全书共包括分子生物学导论以及主要研究内容、环境微生物的分子分类、环境样品核酸的提取、环境组学、环境分子生物学技术及其在环境中的应用、微生物组数据的统计分析和可视化等八章内容。在每章后附有思考题，便于学生自学和总结。