云南金花茶(CamelliafascicularisH.T.Chang)是我国云南特有的山茶属植物资源，作为传统的药食同源植物，因具有多方面的保健功效而备受关注。研究发现云南金花茶不仅与其他金花茶组植物种群的亲缘关系相对较远，有效成分的含量及种类也有所差异，并且其化学组成及生物活性也至今不明。近年来，国内外对云南金花茶的研究逐渐增多，主要集中在资源调查、繁育技术、矿物质元素与活性成分测定、体外抗氧化活性测定以及茶饮料加工等，但云南金花茶有效成分及其生物活性，以及代谢组学和转录组学等方面还有待进一步研究。本论文全面分析和评价了云南金花茶的化学成分；通过现代色谱技术建立了金花茶组植物的指纹图谱；优化了云南金花茶多酚的提取及纯化工艺，评价了云南金花茶多酚抗氧化活性及对细菌感染性炎症的治疗功效，探讨了其抗炎作用机制；全面了解三个产地云南金花茶代谢成分以及抗氧化、抗肿瘤活性，分析了其化学成分及含量的差异；对三个产地云南金花茶进行了转录组测序，并对测序结果进行差异基因筛选以及功能注释，初步挖掘活性成分合成路径的关键基因，为云南金花茶资源及其应用新领域的开发提供科学依据和技术支撑。