本书分为上卷、中卷、下卷。上卷、中卷四十九论，论述五脏六腑虚实寒热生死逆顺辨证方法，下卷附疗诸病药方六十八道。全书禀承《内经》《难经》天人相应、顺应自然和以阴阳为总纲的思想，创新并发展了阴阳学说、脏腑学说的理论。