任性孤僻的富家小女孩玛丽因为突来的瘟疫, 一夜之间成了孤儿, 被送往英国古老庄园里的姑父家收养。在广袤的的荒野和淳朴的乡人中间, 她的性情渐渐变得宽容、平和。有一天, 她在庄园的无数个园子中, 发现了一处神秘的所在……一天深夜, 循着神秘大宅长廊一端传来的隐隐哭声, 她被带到了一个孤独的小男孩面前。这竟然是她的表兄, 大宅的少主人科林。他从小体弱, 常年卧病在床, 性情乖戾难测。为了让科林健康起来, 玛丽犹豫再三决定将他带入自己的秘密花园, 在那里, 一些神秘的魔法正在发生。