《闽台历代方志集成》包括《福建省志辑》《台湾志书辑》《福建府州志辑》《福建县厅志辑》4辑。其中《福建省志辑》《台湾志书辑》汇辑福建历代（截至1949年）和台湾历代（截至1895年）所编的省、府（州）、县三级地方志书，是从历代刊刻的81个刊本中精心筛选出的51种珍贵文献，共138册106752面。内容涉及闽台两地历代以来至民国时期所编方志，其中有许多版本来自海内外孤本、善本和珍本。