《鲁迅思想系统研究》将鲁迅思想看作一个由不同面向组成的整体，进而按照历史意识、哲学理念、宗教观、政治学、文化观、美学、文学、现代性问题这些既互相关涉，又各有区隔的不同思想面向来分别考察，从而建立起一个多面立体的鲁迅思想体系，力图在鲁迅思想研究的科学性、系统化方向上有所推进。鲁迅的伟大值得一代一代中国人去认识，鲁迅的思想值得一代一代中国学者去理解与阐释，20世纪的鲁迅研究已经有了可观的成果，21世纪鲁迅研究的新篇章还有待不断去谱写。

导论
一 认识鲁迅的伟大是我们的责任
二 鲁迅思想研究的历史
三 建立鲁迅思想的系统研究框架

第一章 “中间物”与“大时代”：鲁迅的历史意识
一 鲁迅论“十九世纪”与“二十世纪”
二 “中间物”意识辨析
三 方生方死的“大时代”
四 “历史家的自觉”：后期鲁迅历史观
五 “直面无法直面的”：鲁迅的历史主体性

第二章 虚妄与实存：鲁迅的哲学
一 进化论
二 唯意志论
三 启蒙主义
四 绝望的抗战
五 虚妄主义
结语

第三章 “起死”与“叫魂”：鲁迅的宗教观
一 拒斥中的承担：《坟》中的生·死·爱
二 鲁迅艺术思想中的灵魂意识

第四章 悖论的政治学
一 悖论的政治学
二 复仇政治学

第五章 鲁迅的文化救赎与国民性批判
一 鲁迅杂文中的“技术化观视”及其“教导姿态”
二 鲁迅小说中的“暴力”与“破坏”

第六章 鲁迅与汉语现代性
一 鲁迅与中国现代主义的起源
二 文学性法则的内部突破
三 时间与记忆：“柔和”的鲁迅
四 鲁迅记忆的三重结构
五 维多利亚时代与中国现代性问题的诞生

第七章 鲁迅的美学
一 过渡期的审美意识与混血的精神
二 精神底色中的浙东文化元素
三 诗歌的独特审美境界
四 美术观及与作品中的美术元素
五 特异的审美风格与表现方式

第八章 作为“心学”的文学
概述
一 文学即心学
二 身体言说对心学的补充
三 在与启蒙的对抗中确立文学
四 自省意识构筑文学整体性